我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?听说有一种方法是找相近物种该基因的全序列,然后做比对然后找到内含子位置,再设计引物将内含子区域测序?有没有

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/02 18:37:41
我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?听说有一种方法是找相近物种该基因的全序列,然后做比对然后找到内含子位置,再设计引物将内含子区域测序?有没有

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我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?
听说有一种方法是找相近物种该基因的全序列,然后做比对然后找到内含子位置,再设计引物将内含子区域测序?有没有用过这种方法的?能不能说一下具体怎么操作?选什么物种?用什么软件比较序列?

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为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写,或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链.与RNA链互补的单链DNA,以其RNA为模板,在适当引物的存在下,由依赖RNA的DNA聚合酶(反转录酶)的作用而合成,并且在合成单链cDNA后,在用碱处理除去与其对应的RNA以后,以单链cDNA为模板,由依赖DNA的DNA聚合酶或依赖RNA的DNA聚合酶的作用合成双链cDNA.真核生物的信使RNA或其他RNA的cDNA,在遗传工程方面广为应用.在这种情况下,mRNA的cDNA,与原来基因的DNA(基因组DNA,genomic DNA)不同而无内含子;相反地对应于在原来基因中没有的而在mRNA存在的3′末端的多A序列等的核苷序列上,与exon序列、先导序列以及后续序列等一起反映出mRNA结构.cDNA同样可以被克隆.

我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办?听说有一种方法是找相近物种该基因的全序列,然后做比对然后找到内含子位置,再设计引物将内含子区域测序?有没有 已知一基因两侧序列,如何将该基因克隆你没明白我的意思,是要从如何获得目的基因上来回答;比如,知道一段蛋白质的mRNA序列,就用RT-PCR制备出cDNA,从而克隆。现在是知道两侧序列…… 怎么从genbank中找序列我现在在做一个生物的基因序列分析,需要从GENBANK中找一些别的相似基因做对比. 已知基因名和cDNA位点,如何找到相对应的DNA序列上的位点?例:已知基因名PLEC,NM_201384,exon1,c.14A>G.现在要验证c.14A>G这个位点是否发生突变.我在NCBI中可以查到这个基因相对应的mRNA的序列,可以以 我提取RNA,反转录得到cDNA,我要由此扩增功能基因,请问引物设计时,用查到的mRNA序列,还是用cDNA序列我要克隆一个基因,从NCBI查到该基因近似物种的mRNA(没有查到cDNA).我的路线是先提取RNA,反转录 已知一个cDNA3'端部分序列,设计实验得到该基因的全部cDNA 以一个基因为例,设计至少两种使cDNA序列分离的方法简述其过程 已知一个cDNA的3'端部分序列,得到该基因的全长cDNA这个基因要先筛选出来才用RACE技术. 我最近在构建RNAi载体.在寻找目的基因cDNA与其他基因的非同源序列时,是与DNA比对,还是与cDNA?谢 问几个有关cDNA的问题假设我从基因数据库找到了一个长1.5Kb的真核生物基因的cDNA序列我怎么能证明这个真核基因是够有内含子序列?如果有,怎么确定内含子占基因全长的比例?如果这是个未知 如何在GeneBank登录序列?我现在有几个自己扩增得到的基因序列,想把它们登录到GeneBank,该从哪申请登录 设计克隆一个基因的CDNA序列的实验!注意是实验哦!周四之前!谢谢,满意再+50! 全长基因克隆和cDNA全程克隆之后,下一步都是什么?我现在有很多的困惑,我克隆了一个基因的全长,然后又克隆了它的cDNA的全长,我想知道,两种克隆下来可以继续做什么实验,能得到什么样的结 我如果目的是为了得到该基因的表达产物,而克隆基因,那么引物设计是否上游和下游分别在序列的两端啊?另外,序列是cdna序列还是cds序列? 想获得完整的cds序列,需要通过反转mRNA获得的cDNA里面,PCR出我想要的某个基因的cds的完整序列。是否可以在utr区设计引物?还是必须做RACE? 我现在做克隆全基因序列方面的实验,已经得到了蛋白N-端部分序列,原本想通过3'RACE技术做的,但因为现在 克隆出牛的leptin基因的cdna全长序列?(用race)基因工程题:克隆出牛的leptin基因的cdna全长序列--用race ?急! 已知某一基因的cDNA序列,设计一实验从RNA中获得这cDNA片段并述原理